就在大西、源田正在为起草这份报告而费尽心机，冥思苦索的时候，在联合舰队里，也在独立地进行着关于对夏威夷作战的研究。
一次，在舰队的军官们同山本司令官闲谈时，有人曾含蓄地问山本：“对夏威夷只进行空袭而不占领吗？”
意思是说，美国的海军军人，有相当一部分都驻扎在夏威夷。培养一个海军军官需要很长时间，如果能将其一网打尽或俘虏之，可以严重削弱美国海军的实力，使其士气就此消沉下去，而且在相当一段时期内，很难得到恢复。只是没有直截了当地说出来主张轰炸并占领夏威夷的本意而已。
联合舰队司令部里，设置了四个预备研究小组。首席参谋黑岛龟人大佐对这一研究工作表现得极为热心。他已开始拟制联合舰队司令部的各种作战方案和研究有关的战略战术。袭击夏威夷的作战计划，自然是他研究的重点。
黑岛在联合舰队司令部的军官中，是个性格怪僻，与众不同的人。为了集中精力拟制作战方案，他把自己关在舰上自己的宿舍里，关紧用于密封的舷窗盖。因为司令部所在的“长门”舰上没有冷气设备，房间里很热，他便赤身裸体伏在案上，夜以继日地进行工作，几乎到了走火入魔的程度。房间里点着薰香，烟雾缭绕。他的嘴里还叼着香烟，点了又掐灭，掐灭了又点着。他的脑袋里，除了关于作战方案的构思，好像什么都没有了。
有关黑岛参谋的各种传说很多：黑岛参谋每遇难事，就在舰内踱步沉思；他虽然身为司令长官得力的参谋，但却一次也没跟司令长官一块用过餐；在他的房间里，各种书籍乱七八糟地堆积如山，可他却视若无睹，从不收拾。
因为他行为古怪，勤务兵们把他称为“黑岛怪参谋”，特别是他对日常生活琐事马虎草率，竟办出一些幼稚可笑的事来，所以又称他为“呆子”。
他身着的睡衣就是个明显的例子。睡衣满是污垢，又脏又破，不堪入目，看上去令人作呕。但如果勤务兵不给他换，他就那么穿着。一次，舰队驻泊在吴港，有个勤务兵见他如此狼狈，便自己解囊，一次为他购置了三件睡衣。
有人曾用批评的口气评论黑岛说：
“包括袭击夏威夷最初的作战方案在内，如果完全依靠科学数字，建立在客观的基础上的话，无论如何也不会炮制出那样的方案来。这样一个在常人看来根本不可行的方案，完全出自黑岛的那个反常的脑袋瓜，是硬写出来的。”
4月末，为了解释由他拟制成的关于袭击珍珠港的有关战略和策略，黑岛龟人接受山本的命令，去了东京。
在东京的海军军令部里，第一部（作战部）部长福留繁少将，第一课（作战科）课长富冈定俊大佐和航空参谋三代辰吉中佐都反对联合舰队袭击珍珠港的计划。
尔后的8月7日，黑岛大佐在鱼雷参谋有马中佐的陪同下，为协商这一悬而未决的问题，又一次来到了东京。这时作战部依然坚持原来的反对意见，而且态度更加强硬。黑岛同富冈定俊进行了激烈争论。
富冈定俊强调，海军军令部的作战部并不想也不愿意干预、控制联合舰队。所以，作战部的同僚们平时特别注意这一点，在各种场合，总是尽量控制自己。但是，又不能忘记作为中央（指作战部）的使命：调解海军与陆军的关系；决定兵力的使用和分配；安排各部队的物资和武器的供应等；而且，战争一旦打响以后，首先还要考虑，尽快占领爪哇等南亚产油地区，以确保石油来源，不能像黑岛或山本那样，只考虑珍珠港一举决胜负的问题。
再者，海军军令部的作战部长、航空参谋等之所以不肯在方案上签字，还有一个最大的理由，即就方案来看，袭击的成功有赖于两个不可靠的假设：一是在奇袭时，美国舰队正停泊在珍珠港内，二是一支大型的母舰部队能安全地渡过半个太平洋而不被美国发现。这是很难保证的。他们还强调：不能怀有侥幸心理，而且也不能冒此大险；事实是不以我们的意志为转移的，愿望和可能代替不了现实。
黑岛本着山本的观点，反驳了富冈的意见并进一步强调了一定要袭击珍珠港的理由。
所谓山本的观点，概括地说就是：同美国交战本身就没有胜利的希望可言。明知如此，还要硬着头皮打的话，那就只有在大战的一开始，就先发制人地摧毁对方的主力，打得对方措手不及打破敌我之间旗鼓相当的均衡局势，给敌人制造困难和障碍。除此之外，别无他策。“欲对美作战，就必须袭击珍珠港，否则，这场战争就无取胜的希望。”