人们的生活被二次世界大战给扰乱了。除了人们已经习以为常的货物短缺、配给供应、灯火管制和空袭之外，玛格丽特的学校学习时间也缩短了。1939年10月，坎登女子高中学校从伦敦迁至了格兰瑟姆，并分享凯蒂文学校的教学设备。凯蒂文学校的女学生上午从8点30分到12点30上课，下午是坎登学校的女学生上课，当地的孩子则回家做作业。但是不久，这个城镇也变危险了，坎登学校的学生又匆忙迁到尤平汉姆去了。
作为一个规模不大的乡村城镇，格兰瑟姆受到战争的影响最大。由于地处主要公路线和铁路线上，并且还有一些转为军火生产的工厂，这个城镇成了空袭的主要目标。格兰瑟姆挨的炸弹在英国按人头算，其比例一度是最高的。凯蒂文学校建了两个地下掩蔽所，在空袭来时对所有人都开放，在用铁丝加固的窗子的衣帽间里进行课间活动，有一次经历特别令人难忘，一架德国飞机在学校上方低空飞行，扔下了一排炸弹，炸弹沿着学校曲棍球场挨个地爆炸，离学校主建筑物仅有一英尺。
令人遗憾的是，战争使学校换了一个女校长，深受学生爱戴并且性情温和的学校创立者格拉迪斯·威廉斯小姐退休，由多萝西·吉利斯接任。这是一个脾气相当暴躁的苏格兰女人，总要激怒一些女生。她是一位古典派学者，接任校长后便下令立即在六年级开设拉丁语课程，这门课过去在这个学校从没教过。不过很遗憾，由于该课与理科课程表有冲突，玛格丽特进入六年级时从没有上过吉利斯小姐的课。
这场战争还迫使学校不得不中止组织在英国和国外的旅游活动，过去这个活动是六年级学生的一种额外待遇。取而代之的是，经常被差去在室内捡土豆，收集蔷薇果和黑莓，并且组织“战争武器周”之类的活动。
1941年，在父亲的敦促下，玛格丽特进了六年级上，一心一意争取上大学的奖学金。这回她只能选择学理科课程了，但是到第二年初，她在格兰瑟姆每季度开庭的地方法庭花去很多时间听讲法律程序的课程，在法庭上，罗伯茨先生则作为治安官坐在法官席上。自那时起，她开始感到法律是一门非常有趣的学科。
她向本城的首席法官诺尔曼·温宁爵士吐露了自己的心事，在安吉尔饭店和皇家饭店玛格丽特常常参加她父亲同他进行的午餐。他过去学过自然科学，所以他的教诲常给她带来快慰。他在剑桥大学攻读物理，但后来非常成功地转修了法律。他劝她坚持学理科，因为有些领域的法律工作，比如专利律师职业，是需要理科和法律这两种学历的。
不知出于什么原因，玛格丽特一心想考牛律大学的萨默维尔学院，并决定中学毕业后，也就是在进六年级的第二年底进大学。这在那个时候要比女子上大学的规定时间早一年。她想跳级，那时是战争期间，年满20岁的妇女都被招去为国家服役，她认为在学校多呆一年，是浪费时间。但是她想提前上大学的道路障碍重重，最难逾越的就是吉利斯小姐。
首先，玛格丽特没有学过拉丁语，进牛津和剑桥大学不管哪个学科低级学校的拉丁语及格证书是必须的。其二，吉利斯小姐认为玛格丽特才17岁，远不够上大学的年龄，应在学校再多呆一年。这位女校长是顽固的、直言不讳的苏格兰人，对她来说，这件事没有什么可商量的了。
但是这次吉利斯小姐遇到了对手。许多年里她一直让着老校长的玛格丽特被激怒了，她冲着校长说道：“你不要误了我的前途。”她迅速着手准备起高考的事情。她争取了父亲的支持，并说服他出钱请来私人教师维克托·沃特豪斯教她拉丁语。他是皇家学校的古典语文教师，罗伯茨先生在该校也是董事会的董事。艾尔弗雷德·罗伯茨还进一步寻找各种有助益的人作指导，其中包括卡农·古德里奇。他是考比一格兰教区的牧师，他有个女儿叫玛格丽特，最近刚从凯蒂文学校考上牛津玛格丽特女子学院。除了借给玛格丽特·罗伯茨一些书以外，卡农一家还给她作一些课外辅导，为她高考作准备。剩下来要做的事情就是提出申请了，这件事必须通过校方。罗伯茨先生开了一张支票用来支付她的考试费用，玛格丽特把它交给了吉利斯小姐，就算是获得了认可。
学习异常勤奋的她同时还在争取获得高年级学校的合格证书。她通过惊人的记忆力，成功地在几个月内学完了五年的拉丁语课程。为此，她感到上萨默维尔学院参加入大学考试是足够的了，感到有希望获得读化学的奖学金。