有些逮捕墨索里尼的人认为应该马上将他交给英、美盟军，作为意大利不想再与德国结盟的证据但国王不同意，因为他虽然暗中决定结束这场战争，却又非常害怕德国人，不敢公开挑明。于是，国王在私下寻求某种途径与盟军取得联系的同时，仍假意同意继续进行战争，使德国人产生错觉。
在短时间内，墨索里尼反而因为成了一名囚徒，不再负任何责任，看上去似乎一身轻松。起初，他被关押在蓬察岛，与以前被他监禁的南尼及其他反法西斯主义者住在一起，属于软禁形式，看管不严。一周后，为了更安全起见，他被转移到马达莱纳岛，但仍然受到特殊的待遇他的食谱里每天仍有水果和四升牛奶，而当时在这样偏僻的地方要弄到牛奶并不容易。人们注意到，他显得十分不安，生怕被人毒害他的六十岁生日是在大牢里过的他专心致志地阅读耶稣基督的传记。在和当地的一位神父交谈之后，他表示愿意参加弥撒，这可能是他自童年以来破开荒头一次。
在这几周里，墨索里尼被迫过着悠闲的生活，使他有时间回首自己的一生。他觉得自己和耶稣基督有”惊人的相似之处”，因为他们俩都曾被人出卖。他在此期间也写下一些别的感想，同样说明问题他写道，民众会把昨天的偶像捣得粉碎，但以后又为自己的破坏懊悔不已，这就是生活的准则。他承认自己从来没有过真正的朋友，但总的说来，他认为这是一件好事他相信自己的失败从某种程度上说是命运注定了的。不过，他要别人记住：想当年，他也曾创立过丰功伟绩，不仅被教皇拥立为“上帝派来的使者”，还为全世界带来法西斯主义新生活方式所以，连战斗队员们都没有起来保卫他就更不能使人理解了。他回答说，这也许是因为整个意大利人在性格上都有缺陷，不久他们将会对他的垮台感到后悔。
墨索里尼凭直觉首先认为，意大利应该现在就退出战争，这也是他脑子里多次考虑过的问题可是几天后他就改变了观点，也许是因为那时他已得知，德国人正在设法找到他的下落并营救他墨索里尼也一定能猜测到，对希特勒来说，像他这样一位亲密的盟友遭到监禁简直是一场噩梦，这使领袖人物至高无上、神圣不可侵犯的观念受到冲击。为了找到他的下落，德国人下了工夫他们大量使用伪钞收买情报，甚至利用算命、看相的人去探听他的下落。
为了不让德国人计划得逞，巴多利奥再次将墨索里尼转移别处他们以红十字标志为掩护，用飞机和救护车把他送到亚平宁山脉一个孤零零的高山滑雪场巴多利奥肯定明白对墨索里尼的住处保密是很难办到的，因为整个旅馆必须腾出房子供墨索里尼以及一支人数众多的武装宪兵看守队居住。墨索里尼在这儿住了几周，整日打牌聊天，照老习惯单独就餐旅馆的女经理看到他一天要吃三公斤葡萄，感到非常吃惊。此时，他的腹痛病更为严重。他向旅馆工作人员唠叨他的病情，以此解释他为什么不能认认真真地干事，听得大家都很厌烦。他还说，他宁愿自杀也不愿被交给盟国。有一次，他企图切腕自杀，不过，看上去他并不真心要死。
看守墨索里尼的卫兵事先都接到命令，如果有人企图营救，就将墨索里尼打死。但9月8日，巴多利奥的警察总监又发来一道使人困惑的相反命令，指示卫兵执行早先的命令时“要非常审慎”接着，该命令被撤销，12日又重申有效。后来，巴多利奥在为这反复无常的行为辩解说，他考虑到墨索里尼患癌症已是晚期，最多能活两个月，因此安全问题无关紧要在这种乱糟糟的情况下，空军军官们曾想把他劫往阿根廷，但并未认真策划实施。看守卫兵中有些人则另有打算，试图把他交给德国人，以讨好希特勒。
最后，在9月12日一次出色的突击队行动中，一支德国小分队乘飞机在这个地势险峻的山峰降落小分队指挥官斯科尔兹内上校曾估计会遇到武装抵抗，可结果一枪未发，五分钟内就控制了旅馆。墨索里尼帮着清除简易跑道上的大石块，然后随小分队起飞升天，那些手持卡宾枪的卫兵则向他们挥手告别。
3．东山再起
1943年9月，巴多利奥终于与英、美达成停战协议，纳粹德国马上作出反应，占领了意大利的中部和北部德国的干预是墨索里尼东山再起的唯一寄托，否则，他不会赞同纳粹的行动。接着，经德国人劝说，他组建了一个受德国保护的傀儡政权，从而把意大利分成两个部分，挑起了一场持续一年半之久的残酷内战。