京城中也自西北起，震天动地如霹雳之声，黑气冲天，彼此不辨。先是萧家堰，西至平则门、城隍庙，南至顺城门，倾颓房屋平地动摇有六七里，城楼、城墙上砖瓦如雨点飞下。人先但见烟雾满前，不辨路头，后又被震倒墙屋的响声聒耳，弄得人进不得出不得，路上压死、惊死的人何止万余！个个都是赤身裸体，焦头烂额，四肢不全。工部衙门至十驸马街一带，五六条胡同内，就是官员，也多有死的。顺城门内象房震倒，象也惊得发狂，东奔西走不知踏死多少人。一城中惊得鬼哭神号，此时官民死伤者甚众。直至两三日后方定。后边讹传，是王恭厂火药走发，所以如此。不知火药走发，何以与大同地震同时。钦天监只得按占候书题一本道：“地震者阴有余也，占为主弱臣强，天下起兵相攻，妇寺大乱之象。”忠贤见本，不知修省，反大怒，说他“妖言惑众”，将司天官矫旨杖死，岂不可笑？这正是：
天心原为奸雄警，地震反贻司历灾。
皇上因此避殿撤乐减膳，仍敕各官素服修省。有兵部尚书王永光道：“今天变，实有所为，圣主既见灾知警，我辈为大臣者，岂可避祸不言？”便上疏道：“敬竭葵藿之诚，修陈灾情之实，仰启圣明，亟赐采择，以回天心，以维天运。”大意是说“灾异渐臻，必朝廷政臣有险人，颠倒悖谬，以逢天怒。如刑狱系人生死所关，今累囚半是诏狱，追赃即以毕命。上天好生之德有所未忍，乞悉付法曹。至于军储告匮，土木频兴，与其急土木，不若急军需。议搜括曷若议节省，请于皇极殿告成之日，暂停工作，惜海内之物力并于军前。若夫传宣诏旨，或以误而成讹，不如票拟归之政府。甄别流品，或以疑而成混，不如平讨付之铨曹。”这本内虽未直说忠贤，却都是说的他所做之事。忠贤见了大怒，竟留中不下。次日，礼科给事中彭汝南也上一本：“为天灾人灾同时互见，触目惊心，恪遵明旨，恭陈修省之实，以重天戒，以保泰运。事望圣明除烦去苛，布宽大之政，轻徭薄赋，停不急之工。”同时有个御史高宏图，也上一疏，与彭给事所论大概相同。忠贤把两个本都留中不发。
谁知地震未已，民心尚未定，忽然二十日的丑时，京师又反乱起来，但见：
初时半天皆黑，后来满地通红。烁烁的光分万点，夜阑天畔落疏星；纷纷的焰散千条，天曙晓光开赤雾。遍地上火龙飞舞，半空中火鸽盘旋。人畜争喧，吴骑东风驰赤壁；楼台没影，秦兵三月溃咸阳。
原来是朝天宫正殿火起。这殿只有大朝会百官习仪才开，平时紧闭的，不知何故，忽然烧起。顷刻间，烟焰烛天，沿烧殿后及两廊房屋，共有一百二十余间，俱化为灰烬。直弄得那些道士，驮神像、搬私囊，也有找师父寻徒弟的，一个个哭哭啼啼，东奔西跑。五城御史率领著兵马司工部街道，锦衣卫提督街道等官及各坊番役人等，都带著挠钩火搭来救。那火势越大起来，哪个敢动手？只有袖手看烧。
一月之中两次奇灾，真是小民惶惑，臣工所当修省的时候。那王司马见前疏不下，已知拂了奸阉，便道：“我既不能弭灾转祥，就是失职，该罢；又不能驱奸正法，也该罢。我若不决然求去，感悟君心，反待他片纸出朝，斥逐而去么？”便又上疏道：“天心仁爱，无穷修省，未见明效，谨陈辞求罢，以答天谴。仍乞圣明立行实政，亟赐挽回。乞圣上准行停刑、减税二事。”
吏部尚书王绍征也题一本：“为钦奉圣谕事，乞崇养士节。”忠贤见了，大怒道：“朝天宫火灾，必是奸细在内。因前日地震，百姓惊恐，思欲乘机生乱。可著厂卫各衙门缉捕的用心缉访，三日一比，定要捉拿奸细。如十日内无获，各官一体治罪。这两个老儿就事生风的烦渎，须把他削夺了才好。”
李永贞道：“这两个老儿前日的本都被留中，却也有些没趣。他毕竟要去的，爷若因此逐他们，外面又说爷不能容物了，须再停几日。他若不见机而作，就先把那一班为灾异上本的官处他几个，他们自然要去，那时便与爷无干了。”正在那里计较，要去两个大臣。
不料外边的灾异越凶：武清县天降淫雨，只见：无明无夜，如注如倾。白茫茫六街三市尽横波，急攘攘万户千门皆巨浪。苔生屋角，蛙产灶前。扳楼入阁，浑如野鸟栖巢；逐浪随波，一似游鱼翻浪。正是：