松本深受启发地说：
“所言极是，祝阁下一切顺利，万望多多保重。”
“谢谢！谢谢！”
山本一边致谢，一边站起身来。
继“一号作战命令”之后，联合舰队又发出了第二号命令—“关于开战第一阶段的部署。”
在东京陆军大学，山本签署了同陆军的“作战协定”后，于11月11日午后，乘横须贺航空队的运输机，途经岩国回到了旗舰“长门”号。
11月13日，山本把各舰队（派往南洋作战的舰队除外）的司令长官、参谋长和首席参谋等招集到岩国海军航空队，向他们作了关于作战命令的说明，并征求他们的意见，随后发出指示，没有意外情况，作战日期就定在12月8日，机动舰队的主力集结到千岛群岛择捉岛的单冠湾之后，要在11月下旬从该湾起航，取北向航路往夏威夷进发。“但是”，山本用坚定的口气补充说：
“如果现正在华盛顿进行的日美谈判成功的话，我立即向机动舰队下达撤退命令。那时，即使进击的母舰已经出发，接到命令后也必须调头返航，不去进击夏威夷。”
山本说完后，首先表示反对的就是进击夏威夷机动舰队司令长官南云中一中将。他说：
“已经出发的舰队还要返航吗？这未免太过分了。它不单单会影响部队的士气，而且也不可行。”
接着，又有几个指挥官表示了同样的意见。其中有人说：“这岂不是要把快要撒出去的尿憋回来吗！”
山本听了大为恼火，他声色俱厉地说：
“养兵千日为了什么呢？打仗本身并不是目的。如果有谁接到返航的命令也不打算回来，干脆现在就不要出去，即刻辞职好了！”
据说，经过山本的这一番训话之后，对此再没有持反对意见的了。
据传，就在这一天的会议之前，山本发表了非常感人的训辞，遗憾的是，其内容并没保存下来。他的“我全军将士随时都要有以身殉职的思想准备。”这句感人肺腑的话，大半就是在这个时候讲的。
与会者们为预祝出征顺利，作战如意，特意举行了酒会。席间少不了栗子（象征着胜利）、鱿鱼干这已形成惯例。席间，大家互相勉励，举杯相祝，并乘兴合影留念。
酒会后，井上来到岩国航空队司令的办公室。他一跨进门便看见山本一个人神情忧郁地坐在沙发上，像是在等待参加晚上将在岩国深川饭店举行的慰劳会。于是，他便进前打招呼说：
“太糟糕了，这回，我们将打一场硬仗了。长谷川（清）不也说吗，美国的工业力量是我们的十倍。可是，大臣（岛田繁太郎）这个人，我该怎么说他呢？他说舰队临出发时，他还要专程到岩国来寒暄几句送行。如果他来的话，也一定会笑容满面的，丝毫也不会感到忧虑。”
听了井上的话，山本痛苦地说：
“也许是那样，岛田太无知了！”
据井上所知，这是最后一次山本的反战思想流露于言表。天皇陛下的心里虽然很明白，但还是下了圣断：“开战”。此后，山本对战争再没有过反对的表示。
第二天，即11月14日下午，日本北美航线上的邮船一一“龙田丸”回到了横滨。船上乘有700多名来自美国加利福尼亚洲的归国移民和很多从世界各地回国的日本侨民。日本驻英国的海军武官近藤泰一郎也乘该船回到祖国。
在山本任海军省次官时，近藤为海军省首席副官，曾因恭迎高松宫就任一事，山本斥责过他。
前来横滨迎接近藤的是松永敬介。如前所述，在山本任海军省次官时，松永敬介曾在山本手下任副官兼秘书。后来，也被派往伦敦日本驻英使馆工作。因此，他对英国也很了解。松永患过中心性网膜炎眼病。据说，他在英国使馆工作期间眼病曾一度发作。山本对此非常关心，给他寄去了一笔钱，建议他在英国治疗。后因反复诊断，查不出病因，无奈，于1939年10月回国，前后在英国工作了约一年的时间。因此，对松永来说，他不但深知国内海军省中的内情，而且还能大体上估计到刚刚回国的近藤泰一郎的心情和所持观点。
松永主动向近藤梗概地介绍了当时海军省内的情况，并忠告近藤说：御前会议已经开完，目前军政大事的方针已基本确定在向海军省汇报国外工作和谈到对目前时局的看法时，切不可忘记这一前提。
近藤在伦敦尽管饱尝了德国空军轰炸的苦头。但他还是认为英国并不像日本所估计的那样不堪一击只要德国连续轰炸，就得不战而败举手投降；要使英国屈服，德国不出兵英国本土是不行的。但德国又似乎无兵可出。这从最近德国潜艇击沉英国商船的数量呈下降趋势这一情况也可略知一二。因此，如果根据英国很快就会投降的观点来制定日本政策的话。那么，势必造成失误。近藤曾多次地把自己这一观点和想法，从伦敦电告海军省。但令人不解的是，驻德国柏林的海军武官电告海军省的电报内容，却与近藤的完全相反。